В перекачиваемой насосом воде, всегда содержатся частицы различных примесей, например, песка или ила, поэтому возможны износ и повреждения подвижных частей. Эти частицы могут образовывать значительные отложения внутри труб, которые расположены горизонтально. А вот соединения железа, извести, марганца и всевозможные бактерии, выпадая в осадок могут забить фильтры в скважине и непосредственно перед насосом. Присутствующие в воде коррозионно активные углекислоты, соли и ионы меди негативно действуют на элементы водопровода, способствуя коррозии, особенно в местах стыков. Последствиями этого может быть нарушение герметичности трубопровода. В процессе эксплуатации автономного водопровода также может уменьшаться сопротивление изоляции обмоток двигателя насосной станции.